Kepala Sekolah yang memimpin SMAK PENABUR HARAPAN INDAH sebagai berikut:
| Nomor | Nama | Periode |
|---|---|---|
| 1 | Siwi Tri Wahyuningtyas, M.Pd. | Tahun 2008 - 2009 |
| 2 | Hendro S. Lumbanraja, S.Th., M.Pd. | Tahun 2009 - 2013 |
| 3 | Rugun D Tampubolon, M.Pd. | Tahun 2013 - 2018 |
| 4 | Siwi Tri Wahyuningtyas, M.Pd. | Tahun 2018 - Sekarang |
