Kepala Sekolah yang memimpin SMAK 7 PENABUR sebagai berikut:
| 1 | Dra. Endang Setyowati, MM | periode tahun 2001 – 2007 |
| 2 | Satijan, M.Pd. | periode tahun 2007–2009 |
| 3 | Siwi Tri Wahyuningtyas, M.Pd. | periode tahun 2009–2016 |
| 4 | Dra.Duma M.S. Hutahaean, MM. | periode tahun 2016 – 2020 |
| 5 | Hendro S. Lumbanraja, S.Th., M.Pd. | periode tahun 2020 – Sekarang |
