Sejarah SMPK PENABUR Kota Jababeka
Didirikan pada tahun 2009 di Jalan Doues Dekker No. 1 Kota Jababeka, Cikarang Utara-Bekasi. Pada 5 April 2010 SMPK PENABUR Kota Jababeka memperoleh izin operasional dari Pemerintah Kabupaten Bekasi Nomor 503.15/26-IV/SK-SMP/BPPT/2010.
Pada tanggal 12 November 2015, Terakreditasi ’A’ (sangat baik) dengan nilai 95 berdasarkan keputusan Badan Akreditasi Nasional Sekolah/Madrasah Nomor 02.00/151/BAP-SM/SK/XI/2015.
Angkatan I yang diterima di SMPK PENABUR Kota Jababeka sebanyak 33 siswa. Sampai pada tahun 2016, SMPK PENABUR Kota Jababeka berada pada gedung yang sama dengan TKK dan SDK PENABUR Kota Jababeka, semakin bertambahnya kelas dan ditambahkannya jenjang pendidikan tingakat SMA maka pada 11 November 2017 BPK PENABUR Jakarta meresmikan gedung baru.
Pada tahun 2017 SMPK PENABUR Kota Jababeka pindah ke gedung baru namun masih dengan alamat yang sama.
Pada tahun 2017 SMPK PENABUR Kota Jababeka pindah ke gedung baru namun masih dengan alamat yang sama.
Berikut daftar kepala sekolah yang pernah memimpin SMPK PENABUR Kota Jababeka:
| Tahun | Nama Kepala Sekolah |
| 2009-2010 | Suwarno, S. Pd. |
| 2010-2012 | Suhadi, S. Pd. |
| 2012-2014 | Dra. Titik Rahma Utami |
| 2014-2015 | Ruth I. Mahayati, S. Pd., M. M. |
| 2015-2018 | Sukoto, M. Si. |
| 2019-2020 | Ferry Marwanti, S. P., M. P. |
| 2021-sekarang | Robertus Dri Harnanto, S. Pd. |
