Ada tiga ruang kelas di SMPK BPK PENABUR Jatibarang, Ruang Kelas 7, Ruang Kelas 8, dan Ruang Kelas 9. Masing-masing kelas dilengkapi dengan infokus, sehingga bisa memaksimalkan kegiatan pembelajaran. Sirkulasi udara dan cahaya juga dibuat sedemikian rupa sehingga peserta didik nyaman saat belajar di kelas.
