TKK 3 PENABUR Jakarta berdiri tanggal 01 Juli 1958.
Lokasi pertama di GKI Jabar Jln. Bekasi Timur IX No. 6.
Lokasi kedua di Jln. Cipinang Jaya Raya No. 368, tanggal 01 Juli 1994
Lokasi ke tiga di Jln. Tarum Barat Blok KK Cipinang Indah II, tanggal 01 Juli 1996
Lokasi ke empat TKK 3 pindah ke gedung baru di sebrang gedung sebelumnya, mulai pada tanggal 15 Oktober 2009 dengan alamat yang sama.

TKK 3 PENABUR dipimpin oleh:

1. Ibu Gina Utari pada tahun 1990-1991

2. Ibu Itta The pada tahun 1996/1997-2011-2012

3. Ibu Megawati pada tahun 2012/2013-2016/2017

4. Ibu Agustina Soetrisna pada tahun 2017-2018

5. Ibu Jesslyn Bestari pada tahun 2018-2019

6. Ibu Titi Muhani pada tahun 2019-sekarang