BPK PENABUR tidak dapat terlepas dari naungan Gereja Kristen Indonesia (GKI), termasuk salah satunya adalah BPK PENABUR Bogor. Awal mula berdiri pada tahun 1935 dengan nama Sekolah Methodist Baru (The New Methodist English School) yang mengelola tingkat SD dan SMP, kemudian dihibahkan kepada Badan Pendidikan Tiong Hoa Kie Tok Kauw Hwee Khu Hwee Djabar (BP THKTKHKH Djabar) yang resmi didirikan pada tanggal 19 Juli 1950. Badan Pendidikan THKT-KHKH Djabar berubah nama menjadi BPK Djabar pada 27 Januari 1967. Kemudian membentuk kembali BPK Jabar KPS Bogor yang berdiri pada 26 Juli 1961. Pada tanggal 17 Juni 1966 diresmikan TKK BPK Jabar yang berlokasi di Jalan Suryakencana. Pada tahun 1983, SMPK BPK Jabar menempatkan lokasi baru di Bogor Baru. Di lokasi yang sama pada Tahun Ajaran 1984/1985 dibukalah SMA BPK Jabar Bogor.
21 Maret 1989 BPK Djabar mengganti nama menjadi Badan Pendidikan Kristen PENABUR (BPK PENABUR) yang disetujui dalam Persidangan Majelis Sinode ke-46 GKI Jawa Barat tanggal 1 Juli 1989. Kemudian, BPK PENABUR Bogor kembali pindah lokasi ke Jalan Paledang yang diresmikan pada 22 Agustus 1998 untuk jenjang TK, SD, dan SMP. Dilanjutkan dengan didirikan Sekolah Nasional Plus BPK PENABUR Bogor, pada tanggal 1 November 2002 resmi didirikan Preschool dan Kindergarten Nasional Plus BPK PENABUR Bogor. Sekolah ini melakukan kegiatan belajar pada Tahun Pelajaran 2003/2004 yang berlokasi di Ruko Danau Bogor Raya. Jumlah siswa semakin bertambah, pada tahun 2005 pengurus memutuskan membentuk rintisan SD Nasional Plus BPK PENABUR Bogor.
Pada tanggal 26 Juli 2008 diresmikan Gedung TK – SD Nasional Plus BPK PENABUR Bogor di Sentul City. Seiring berjalannya waktu, dilanjutkan pembangunan lahan untuk jenjang SMP dan SMA. Pada Tahun Pelajaran 2011/2012 resmi dibuka penerimaan siswa baru SMP Nasional Plus BPK PENABUR Bogor. Dilanjutkan pada Tahun Pelajaran 2014/2015 dibuka pendaftaran siswa baru untuk SMA Nasional Plus BPK PENABUR Bogor.
Pada tahun 2010, SMA BPK PENABUR Bogor yang berlokasi di Bogor Baru ditutup. Kemudian pada Tahun Pelajaran 2016/2017 mulai persiapan proses pembangunan SMA BPK PENABUR Bogor yang berlokasi di Jalan Paledang.
BPK PENABUR Bogor terus meningkatkan perkembangan pendidikan Kristen. Saat ini BPK PENABUR Bogor berada di 2 kompleks, Paledang dan Sentul City dengan jumlah 8 sekolah. BPK PENABUR Bogor akan terus menjadi pendidikan unggul yang dapat menciptakan generasi bangsa yang bermutu, baik dalam akademis maupun karakter berdasarkan Nilai-Nilai Kristiani.
© 2019 YAYASAN BPK PENABUR