TKK PENABUR Bintaro Jaya memiliki program unggulan yaitu Program Pendidikan Entrepreneurship. Program Pendidikan Entrepreneurship meliputi isi, metode, dan kegiatan yang mendukung siswa dalam mempraktikkan, menemukan, menciptakan, serta melakukan tindakan berdasarkan peluang, dan merupakan keunggulan bagi PENABUR dalam rangka mempersiapkan peserta didik menjadi pembelajar abad 21. Tujuan pendidikan entrepreneurship di TKK PENABUR Bintaro Jaya yaitu membentuk generasi yang memiliki karakter, pengetahuan dan keterampilan, menjadi BEST ENTREPRENEUR yang berdampak positif bagi diri sendiri, orang lain, dan lingkungan sekitar. 

Tahapan pembelajaran dilaksanakan dengan menggunakan siklus belajar Learning Chain – 3DsE. Dalam proses pembelajaran yang berdasarkan Learning Chain - 3DsE, guru bertindak sebagai fasilitator bagi peserta didik dengan tahapan belajar sebagai berikut :