SDK 2 PENABUR memiliki beragam ekstrakurikuler yang bertujuan untuk mengasah kecerdasan majemuk yang dimiliki oleh masing-masing siswa.
Ekstrakurikuler wajib yang harus diikuti oleh semua siswa adalah PRAMUKA.
Kegiatan ekstrakurikuler pilihan antara lain:
1. MANGA
2. MELUKIS
3. KARATE
4. ENGLISH CLUB
5. MATH CLUB
6. SCIENCE CLUB
7. CLAY ART
8. ROBOTIK
9. ANSAMBEL
10. DRUM BAND
11. CATUR
12. TEATER
13. MODERN DANCE
14. KOLINTANG
15. ANGKLUNG
